Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms