Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms