Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBBP68871 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBBP68871 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms