Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS29P62273 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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