Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCS1P62166 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCS1P62166 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms