Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RND3P61587 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RND3P61587 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RND3P61587 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RND3P61587 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RND3P61587 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RND3P61587 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RND3P61587 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms