Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF3P61204 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARF3P61204 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARF3P61204 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARF3P61204 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms