Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP54P61011 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP54P61011 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP54P61011 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP54P61011 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms