Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms