Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms