Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms