Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms