Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms