Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1B3P54709 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms