Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOSBP53539 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOSBP53539 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms