Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARFIP1P53367 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms