Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK8P49336 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK8P49336 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms