Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NESP48681 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NESP48681 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NESP48681 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NESP48681 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NESP48681 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NESP48681 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NESP48681 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms