Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms