Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms