Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA4P43694 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms