Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms