Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOLR3P41439 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOLR3P41439 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms