Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms