Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTPDP35247 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms