Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms