Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CASQ1P31415 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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