Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms