Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms