Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN4P29074 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms