Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB3P28472 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB3P28472 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms