Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD1P28340 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD1P28340 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD1P28340 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD1P28340 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms