Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms