Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CNTFRP26992 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTFRP26992 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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