Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTX3P26022 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTX3P26022 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTX3P26022 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTX3P26022 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTX3P26022 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTX3P26022 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms