Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL1P22362 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms