Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms