Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM21P19474 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms