Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF3P18847 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF3P18847 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms