Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRAP18433 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRAP18433 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRAP18433 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRAP18433 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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