Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XBP1P17861 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XBP1P17861 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
XBP1P17861 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XBP1P17861 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XBP1P17861 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XBP1P17861 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms