Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB4P17483 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms