Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA1P17302 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA1P17302 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA1P17302 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA1P17302 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms