Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VEGFAP15692 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms