Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPBP14678 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms