Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRG2P13727 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRG2P13727 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms