Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLBP1P12271 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms