Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL3P10147 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms