Protein–RNA interactions for Protein: P0DN87

CGB7, Choriogonadotropin subunit beta 7, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB7P0DN87 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB7P0DN87 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB7P0DN87 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB7P0DN87 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB7P0DN87 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB7P0DN87 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB7P0DN87 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB7P0DN87 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CGB7P0DN87 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CGB7P0DN87 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CGB7P0DN87 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB7P0DN87 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB7P0DN87 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms