Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2AF1L5P0DN76 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms